El Laboratorio de Investigación de Química de Proteínas brinda soporte para los diferentes proyectos de investigaciones que así lo requieran, tanto internos como externos, el laboratorio aplica las técnicas de la Proteómica en campos de la Biotecnología, en Tecnología de Alimentos, Ciencia de la Salud, Ciencias Ambientales entre otros, donde se requieren estudios a nivel molecular de profundización en Ciencia Básica es así que a través de uso de poderosas herramientas moleculares se logra por ejemplo la identificación rápida de péptidos específicos de especie, de aplicabilidad general, entre otros estudios.